1、由於r版本較低,導致無法使用最新版bioconductor上最新的r包;
2、不同版本的r對應不同版本的bioconductor,對應不同的官方安裝包的指令碼;
3、不要試圖跨越bioconductor與r版本固有的對應關係。
所以,我們最終建議,等到r-3.6.0到來時進行更新,而截至本稿,最新的r-3.6.0已經發布:
對於r語言的安裝,如果是windows系統:
福利如果是mac系統,參考:
r語言 | 可以愉快的更新最新版r了!
如果是linux系統,則參考:
軟體安裝 | centos下安裝配置r
r安裝完成後,可以進行bioconductor包的安裝。經前文 r語言 | 你知道自己的bioconductor版本麼?我們知道,在新版r-3.6.0對應的bioconductor v3.9中,包的安裝命令發生的變化,而基礎安裝包由biocinstaller變為了biocmanager包,故首先需要安裝biocmanager包:
install.packages("biocmanager")
完成後,可以直接使用biocmanager包中的install
函式進行包的安裝,以hpar包為例:
biocmanager::install("hpar")
很順利,檢視已安裝的hpar版本:
packageversion("hpar")
[1] 『1.26.0』可見,此時hpar包版本為v1.26.0,而當我們將r從v3.5更新至v3.6之前則只能安裝v1.24.0版本的hpar,導致無法訪問最新的hpa資料庫!
r語言 | 如果你再問我怎麼安裝r包
p_delete(hpar) # 解除安裝已安裝的hpar包
p_load(hpar) # 安裝
1、在r中報錯會使得程式中斷,而警告一般不會影響程式進行
r語言 | 關於包的載入
2、是在安裝之前判斷了不存在這個包,所以不代表未安裝成功,很明顯,沒有報錯
r語言 | r包安裝**
綜上,我們完成了r-3.6.0的安裝和包管理配置
讀取較大的excel檔案
將分析結果追加輸出到**檔案
包載入報錯排除
讀取壓縮檔案、讀取網頁中的**檔案
統計不同組患者的生存時間
na值替換的n種方法
多重假設檢驗校正
showtext-字型設定
pubmed可以這樣玩
我想,所有的事情應該都會如期而至
生活該是什麼樣子,嗯,一談到生活,就覺得要感性了。還好,我覺得自己改了很多,已經慢慢地學會理性了,一切都歸功於某同學。只是有時候大腦開小差,完全管不住自己,就感性的不行,於我而言,我還是一直保持理性比較好的,一感性起來,準會捅婁子,我是看清楚自己了的。生活該是什麼樣子,我想應該就是我喜歡的樣子 被師...
「她」們來了,如期而至! 微軟中國女性大會
微軟2016女性大會於5月順利登入深圳 上海及北京!職場女神零距離交流,健康講座 溝通講座給小主們工作生活全助攻,還有精美午餐 幸運禮品侍奉左右。精神收貨 物質收貨 滿載而歸,讓我們好好看看微軟鏗鏘麗人如何綻放精彩!深圳站 2016年5月10日,微軟中國女性大會首先登陸深圳,吸引了上百位各行各業的女...
R ubuntu下安裝和更新R語言
r官網更新說明 本文主要講解在ubuntu下如何安裝和更新r語言。將分別介紹什麼是r語言,簡單方法安裝r語言,通過更新源來安裝或更新r語言,和安裝r語言整合開發環境。r語言是主要用於統計分析 繪圖的語言和操作環境。r本來是由來自紐西蘭奧克蘭大學的rossihaka和robertgentleman開發...