這聽起來像是出自《星際迷航》之類的科幻片,但是液-液「相分離」實際上是表觀遺傳學領域的新熱點。具有某些特徵的蛋白質的相分離致使形成了生物分子液體「液滴」,液滴濃縮了某些蛋白質/因子,而阻隔了其他蛋白質/因子。epigenie文章的「原始系列」討論了該現象與通過ythdf蛋白調節m6a甲基化的mrna轉錄以及由hp1蛋白形成異染色質的相關性。現在,奧地利維也納醫科大學alwinköhler領導的研究團隊在對酵母組蛋白h2b泛素化的分析中,取得了令人驚訝的與相分離有關的發現!
酵母中組蛋白h 2b第123位賴氨酸的單泛素化發生在大多數基因的啟動子、基因體和終止區域,並通過調節核小體核心顆粒的組裝、穩定性和組蛋白甲基化發揮轉錄作用。在他們的新研究中,研究小組現在確定,泛素化相關因子的液-液相分離會產生染色質相關的表觀遺傳「反應室」,從而促進組蛋白h2b沿基因體的泛素化。
讓我們從科幻**轉向科學事實,聽聽gallego和同事們關於這項新研究的所有細節:
bre1和lge1的結構
lge1與bre1形成核-殼冷凝物
從科幻**到科學事實,所描述的資料提供了證據,表明液-液相分離有助於形成組蛋白修飾酶的分層冷凝物,從而產生染色質相關的「反應室」,進而促進沿基因體的泛素化活性的增強。作者還提出通過液-液相分離形成反應室的過程可能發生在人類細胞中,對該過程的損害可能會促使神經系統疾病的發作。
köhler表示:「將芽殖酵母作為一種模式生物進行研究,給了我們前所未有的機會來研究和理解使層狀液體在細胞核中發揮作用的化學原理,我們還意識到了它與人類疾病的潛在聯絡」。
gallego l d, schneider m, mittal c, et al. phase separation directs ubiquitination of gene-body nucleosomes[j]. nature, 2020: 1-6.
m6a甲基化修飾是真核生物mrna甚至病毒rna廣泛存在的一種rna修飾形式。m6a修飾早在上世紀70年代就已經被報道,但對該修飾在rna中的整體分布以及其對基因表達調控的影響一直以來卻知之甚少。2023年,第乙個真正意義上的rna去甲基化酶fto的報道,使得mrna/lncrna的甲基化研究再次進入人們的視野。易基因的微量merip測序方法,通過m6a特異性抗體富集和測序,是用於研究rna的m6a的有力工具。
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