前言工具**後記
這麼大喜的日子,就給大家提供乙個簡單的go/kegg富集分析的工具吧,直接將下面**匯入r裡執行就可以得到結果了。
每次只需要修改:
file="go-0520.xlsx"
page=4
這兩個即可。
其中,go-0520.xlsx
是檔名,page
是xlsx檔案的sheet數。
關於檔案go-0520.xlsx的形式如下:
# 每次只需修改頁數和檔名即可
file="go-0520.xlsx"
page=4
if (t)
for (i in 1:page)
# 基因轉換
if (t)
# kk
if (t)
# go
if (t) )
go1=go_enrich_results[[1]]@result
go2=go_enrich_results[[2]]@result
go3=go_enrich_results[[3]]@result
write.csv(go1,paste0('go/',names(degs)[i],'_bp.csv'))
write.csv(go2,paste0('go/',names(degs)[i],'_mf.csv'))
write.csv(go3,paste0('go/',names(degs)[i],'_cc.csv'))}}
最後可以得到go和kegg的結果,以**形式存在:
go結果如下:
kegg結果如下:
具體內容形式如下:
今天沒有後記,因為明天,大家還要繼續過節
一鍵回家 Excel一鍵美化報表
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