cpt檔案：該檔案為模擬斷點檔案(check point，.cpt)。該檔案為模擬過程固定時間間隔產生，儲存模擬系統所有資訊。該檔案一部分可以在能量檔案(.edr)找到，一部分可以在雙精度軌跡檔案(.trr)中找到。如果模擬因為外界條件中斷，可以使用該檔案重新在斷點處開始模擬，以節省模擬時間。同時也可以依靠該斷點檔案開始，並延長模擬計算(見tpbconv)。
edr檔案：系統能量檔案(energy，.edr)。該檔案記錄模擬輸入檔案中定義的能量組的各種相互作用能量等。
eps檔案：封裝檔案格式(.eps)，並不是gromacs自身檔案格式，可以當開啟。linux系統下一般已經有預設開啟程式，windows要安裝其他開啟程式。gromacs的dssp等通過xpm2ps處理後都是這個檔案格式。
g87檔案：分子座標檔案(.g87)。該檔案記錄並只記錄原子座標和速度，不含原子序號。並只記錄常壓強模擬系統的盒子資訊。
g96檔案：分子座標檔案(.g96)。gromos96程式的分子座標檔案，模擬程式以c語言格式寫入，精度較高，但是會比較大。包含有檔案頭，時間步，原子座標，原子速度，以及盒子資訊等。
gro檔案：分子座標檔案(.gro)。gromacs的最主要分子座標檔案。該檔案型別的各個文字列字數固定，c語言的寫入格式為："%5d%5s%5s%5d%8.3f%8.3f%8.3f%8.4f%8.4f%8.4f"。具體固定文字列有：殘基序號，5位數；殘基名稱，5字母；原子名稱，5字母；原子序號，5為數；原子座標三列，x，y，z座標各8位數，含3個小數字；速度同坐標，速度單位為nm/ps(km/s)。
itp檔案：分子拓撲檔案(.itp)。被主拓撲檔案(.top)包含的分拓撲檔案，一般包含某個特定分子的型別。與主拓撲檔案區別是它不引用其他力場檔案，同時不包含[system]，[molecule]等拓撲位元組。
m2p檔案：xpm2ps程式配置檔案，定義輸出eps檔案中顏色，字型種類及大小等。
mdp檔案：gromacs的模擬配置檔案(.mdp)。該檔案所含定義較多，各關鍵字的含義可以查閱gromacs手冊。
n2t檔案：原子名稱及型別對照檔案(.n2t)。x2top程式可以按照原子名稱得到該原子的原子型別力場引數，n2t就是x2top程式掃瞄的資料庫，檔案很小。檔案中文本行有原子名稱，原子型別，原子電量，原子質量，該原子與其他原子成鍵距離等。
ndx檔案：原子索引檔案(.ndx)。該檔案含原子的序號，當使用make_ndx程式生成索引檔案時，可以定義不同的原子組，每組名下即是該組所含各個原子的序號。
pdb檔案：分子座標檔案(.pdb)。
rtp檔案：殘基力場引數檔案(.rtp)。該檔案包含常見殘基的力場資訊，包括殘基所含原子，成鍵種類等。使用pdb2gmx處理pdb檔案時，程式按照pdb檔案資訊，在rtp檔案中尋找對應的殘基力場資訊。
top檔案：模擬系統的拓撲檔案(.top)。該檔案就是所謂十分及其著名的系統拓撲檔案，其包含各個關鍵字都十分易懂；一般其還包含引用其他力場檔案(#include)。top檔案一般由pdb2gmx產生，grompp程式生成模擬tpr檔案時使用。
tpr檔案：模擬打包檔案(.tpr)。該檔案打包模擬需要各種資訊，包括模擬系統，模擬控制等。
trj檔案：全精度軌跡檔案(.trj)。該檔案包含模擬系統模擬各個時間下的原子座標，速度和受力等。所含幀數頻率由mdp檔案控制，檔案較大。
xpm檔案：資料矩陣檔案(.xpm)。該檔案矩陣中每個值即是矩陣點所表示的物理量大小(也可以是布林值)。該檔案其實就是二維圖，可以使用xpm2ps轉換為。
xtc檔案：模擬軌跡單精度檔案(.xtc)。單精度軌跡檔案，檔案較trr和trj小，為常用分析檔案。包含模擬系統中原子座標，模擬時間，和模擬盒子資訊。
xvg檔案：二維圖示檔案(.xvg)。二維畫圖工具xmgrace的預設檔案，可以使用xmgrace開啟。
aminoacids.dat
該檔案儲存gmx預設的蛋白質和核算的預設殘基名稱。如果計算過程要建立乙個新的蛋白質或者核算殘基，可以將新的殘基名稱加到該檔案中，並增加檔案第乙個的整數即可。有時候可以將該檔案拷貝到當前工作資料夾進行編輯，以不影響其他計算的命名(gmx的檔案搜尋總是從當前目錄開始的)。
ff.dat
gmx預設力場列表，即pdb2gmx處理pdb檔案時可以選擇的立場列表。增加新的力場，可以編輯該檔案，並修改檔案第一行的整數，使其與力場種類數目一致。
specbond.dat
gmx處理特殊化學鍵的檔案，特殊化學鍵包括二硫鍵，血紅素鐵原子於其他原子成鍵等。該檔案第一行指明特殊鍵對的數目，第二行開始即為各個特殊鍵對的資訊，其中第一列為鍵對第乙個殘基的名稱，第二列為該殘基成鍵原子的名稱，第三列為該原子可以成鍵的數目，第四到第六列為成鍵另乙個殘基的資訊，第七列為該化學鍵的平衡長度，此後兩列為成鍵後殘基的新名稱。
vdwradii.dat
原子范德華半徑資料庫。使用genbox為系統新增水分子，或者使用genion為系統新增離子時，各個原子間的距離要大於兩個原子范德華半徑之和，否則為原子重疊。
AD9匯入CAD檔案做封裝外框
在用ad9 不知道ad9的同志請問度娘 的工作中，經常要畫一些封裝，ad9自帶的封裝製作器也還可以用，但是一些比較複雜外形的封裝就比較麻煩了。在這個時候，如果使用autocad軟體來製作外形，就會方便的多了。本文以製作乙個cr2032電池座為例介紹了ad9匯入cad檔案的方法，僅供參考，軟體 ad9...
live555生成庫檔案
若需要將live555編譯共享庫，可以借助config.linux with shared libraries配置檔案。首先需要修改配置檔案的交叉編譯器 1 在該檔案26行處新增 26 cross compile?opt friendlyarm toolschain 4.5.1 bin arm no...
stm32生成bin axf檔案
圖1 如圖1錯誤記錄一下在使用stm32生成bin axf檔案注意的問題。生成bin axf檔案的路徑要選擇正確，比如工程當前目錄使用.也沒有問題 我的bin檔案放在工程目錄下級目錄bin中，故使用.bin a1 boot f3.bin 生成bin axf檔案需要設定一些選項，如圖2和3 圖2 圖3...