如何安裝biopython Biopython安裝

2021-10-11 09:48:05 字數 932 閱讀 7407

本節介紹如何在計算機上安裝biopython。它非常容易安裝,不超過五分鐘就可以安裝完成。

第1步 - 驗證python安裝

biopython旨在與python 2.5或更高版本一起使用。因此,必須首先安裝python。在命令提示符中執行以下命令:

> python --version

如下所示:

第2步 - 使用pip安裝biopython

在所有平台上都可以從命令列使用pip輕鬆安裝biopython。鍵入以下命令 -

> pip install biopython

螢幕上將顯示以下結果 -

要更新舊版本的biopython,鍵入以下命令 -

> pip install biopython –-upgrade

螢幕上將顯示以下響應 -

執行此命令後,在安裝最新版本之前,將刪除舊版本的biopython和numpy(取決於biopython)。

第3步 - 驗證biopython安裝

現在,您已經在計算機上成功安裝了biopython。要驗證biopython是否已正確安裝,請在python控制台上鍵入以下命令 -

它顯示了biopython的版本。

備用方式-使用source安裝biopython

要使用源**安裝biopython,請按照以下說明進行操作-

> python setup.py build

它將從下面給出的源**構建biopython -

現在,使用以下命令測試** -

> python setup.py test

最後,使用以下命令安裝 -

> python setup.py install

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