Python 數值區間處理（py part）

存在多個不連續的數值區間，如 [1,10] 、[20,50] 、[100,200] … ，此時該如何高效判斷乙個數值在這些區間內？

生物學資料分析中，有時需要判斷 snps 是否在 chipseq 或 atacseq 的 peak 區域內，並刪除掉不在這些區域內的 snps。在這些需求中， peak 區間的數量可能達到數萬之多，如何僅用一次迴圈就能達到目的？

pip install py-part

from part import interval

interval = interval[

int]
(lower_value=
10, upper_value=20)
print
(interval)
# [10;20)
bool_ =
12in interval
print
(bool_)
# true

interval = interval[

int]
(lower_value=
10, upper_value=
20, upper_closed=
true
, lower_closed=
false
)print
(interval)
# (10;20]

interval = interval[

str]
(lower_value=
"abc"
, upper_value=
"def"
, upper_closed=
true
)# ['abc';'def']

a = interval[

int]
(lower_value=
10, upper_value=20)
b = interval[
int]
(lower_value=
15, upper_value=30)
# 判斷a與b區間是否存在交集
a.overlaps(b)
# true

a = interval[

int]
(lower_value=
10, upper_value=20)
b = interval[
int]
(lower_value=
15, upper_value=30)
# 判斷a與b區間的起點是否相同
a.starts(b)
# false
# 判斷a與b區間的終點是否相同
a.finishes(b)
# false

from part import frozenintervalset

a = frozenintervalset[

int]([
2,(6
,7),
(8,9
,none),
(10,11
,true
,true)]
)print
(a)# [2;2] | [6;7) | (8;9) | [10;11]

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