本文是根據我學習一年fmri相關知識所總結的內容,我將會以我目前所學知識從使用的開發工具,處理步驟逐步介紹以及當前所研究的方向進行介紹。文中涉及的各種資料我將上傳到我的github中
功能性磁共振成像(functional magnetic resonance imaging,fmri)通過使用bold訊號應用於研究腦科學和認知科學。
工欲善其事,必先利其器。借助優秀的開發工具可以達到事半功倍的效果。我比較常用的工具如下:
xjview12:用於觀察大腦啟用結果的工具,比spm中自帶的display好用的多。
mricron:裝機必備牆裂推薦,其中包含兩個比較重要的可執行檔案,分別是dcm2niigui.exe以及mricron.exe,dcm2niigui.exe是帶有gui的乙個程式用於將dicom檔案,俗稱原始資料檔案,轉換為可執行的nifti,字尾為nii格式的檔案。
通過將所選擇的資料夾(這裡強調一下是乙個被試的單個試次,即乙個session內的資料夾)拖入即可,程式會自動在該資料夾下生成若干個nii的檔案,產生的nii檔案數量與進行掃瞄的time points的數量有關,通常乙個time point代表機器掃瞄乙個全腦。檔案可以選擇轉換成3d或者4d的檔案,通常推薦採用4d檔案即乙個檔案中包含了time points個數量的全腦掃瞄影象
其中的mricron.exe可以用於檢視掃瞄的資料,比如掃瞄的時間點,掃瞄的層數等多種引數
gretna:用於研究圖論的工具
這一部分的內容就到此結束啦~歡迎各位批評指正!
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