fastq-dump /path/to/###.sra在無參組裝時,使用trinity軟體在使用以上預設命令後報錯會提示使用以下的命令:
fastq-dump --defline-seq '@$sn[_$rn]/$ri' --split-files file.sra故最後得到命令是這樣的:
fastq-dump --defline-seq '@$sn[_$rn]/$ri' --split-3 file.sra -o ../02.fastq習慣預設輸出到上一層目錄中的02.fastq這個資料夾中。想要輸出到別的位置記得修改
-o|--outdir
引數喲
選加引數:
因為接下來會做蠻多的轉錄組或者基因組相關的工作,fastq-dump軟體簡直是大寶天天見,就像我陳飛師兄說的一樣garbage in, garbage out
這第一步就出了岔子後續再怎麼分析都是白搭(突然想起我那11月開始做實驗到現在乙個多月因為一開始引物設計反了導致實驗一點結果都沒有的師兄。。心疼)
我的專案中 git tag日常基本命令
前言 在 專案管理中,我們需要不僅使用到分支branch,還需要熟練掌握打tag的方式進行 的版本控制。建立本地tag git tag v1.0.0tag編寫備註 git tag a v1.0.0 m 注釋 提交本地tag到遠端 git push origin tags刪除本地tag git tag...
搞IT,我的日常工具
第一次在csdn上發帖,但願不是最後一次,也希望自己能夠堅持下去。不論是技術內容還是生活感悟,本人力求積極正面,傳遞正能量。這個部落格是是個公共的share交流平台,促使我跟大家討論學習,同時也是我個人的乙個學習及心路的乙個記錄,乙個筆記。1.notepad 很不錯的的乙個編輯工具 2.cygwin...
我的c 日常學習
目錄 我的c 學習 一 一。我的第一此程式 hello world 你好世界 二。編譯需要的快捷鍵 三。程式的註解 四。變數的命名規則 五。數字整形 六。轉義字元 七。修飾的字串 九。一元運算子 二元運算子 三元運算子 十。數字穿的連線 十一。賦值運算子 十二。運算子的優先順序 十三。讀取使用者輸入...