nucletide blast
blastn
短序列標準搜尋
megablast
相似序列（單物種）之間比對
discontiguous megablast
跨物種序列比對
protein blast
blasp
標準搜尋
psi-blast
使用blastp搜尋結果構建位置特異性得分矩陣（pssm）
phi-blast
發現具有相同表達模型且相似的蛋白質序列
blastx
核酸序列轉換成蛋白質序列搜尋
tblastn
蛋白質序列轉換成核酸序列搜尋
tblastx
核酸序列轉換成蛋白質序列，在將核酸資料庫轉換成的蛋白質資料庫中搜尋
對genbank中人類vangl2基因的mrna進行比對搜尋。
輸入：refseq檢索號nm_020335
job title：任務名稱
database：核酸資料庫檢索
optimize for：程式選擇，簡單的blastn即可
expect threshold：期望值，越小越嚴格
等待：
結果：
c語言文字區域性修改
兩種方法修改區域性資料 已在記憶體中修改過單行資料後直接呼叫該函式 void rebuildfile list a list為結構體指標，指標a指向已修改部分鍊錶 fclose p1 fclose p2 remove date.txt 刪除date.txt檔案 rename date2.txt da...
生物序列區域性比對之Blast演算法
演算法基本原理 blast演算法是 1990 年由altschul 等人提出的兩序列區域性比對演算法，採用了一種短片段匹配演算法和一種有效的統計模型來找出目的序列和資料庫之間的最佳區域性比對效果。blast 演算法是一種基於區域性序列比對的序列比對演算法。廣泛被使用在蛋白質 dna序列的分析問題中，...
儲存過程的基本語法與區域性變數
create procedure 過程名 可以寫引數列 儲存的過程體 create procedure 過程名 可以寫引數列 begin 儲存過程的方法體 塊 增刪改查sql語句 endcall 儲存過程名 show procedure 儲存過程名 show create procedure 儲存過...