根據醫囑的時效性和內容，分別對不同醫囑的書寫規範描述如下：
2.1. 長期醫囑
長期醫囑包括患者姓名、科室、病區、床號、住院號、起始時間、醫囑內容、醫師簽名、停止時間、停止醫師簽名、執行時間（首次執行）、執行人簽名。
醫囑內容的要求詳見後。
2.2. 臨時醫囑
臨時醫囑包括患者姓名、科室、病區、床號、住院號、醫囑下達時間、醫囑內容、醫師簽名、執行時間、執行人簽名。
醫囑內容同長期醫囑。
醫師在書寫醫囑時，需要區分長期醫囑和臨時醫囑，但不會刻意區分醫囑內容是哪種內容，而是連續書寫下來。所以在錄入醫囑時應區分長期醫囑和臨時醫囑，而不要強制區分藥物醫囑或診療醫囑等。
2.3. 醫囑內容
2.3.1. 護理醫囑
護理醫囑內容一般包括：護理常規、護理等級、病重或病危（如果不是可以寫）、隔離種類（如無特殊可以不寫）、飲食、體位（如無特殊可以不寫）、陪客（可以不寫）。大部分護理醫囑與費用無關，處理類似於囑託醫囑，有些護理醫囑與費用相關，如護理等級，處理類似於診療醫囑。
2.3.2. 囑託醫囑
囑託醫囑是指醫師在醫療過程中對患者或診治過程的囑咐，一般情況下囑託醫囑是一種自由文字，不涉及費用收取。如「飯後少量活動」、「嚴禁飲酒」等。
2.3.3. 西藥及中成藥醫囑
西藥和中成藥醫囑是用藥醫囑的一種，也是醫囑中最常見的內容，包括：藥物名稱、單次劑量、每日用次、給藥途徑、是否皮試、注意事項等。
西藥及中成藥醫囑中應使用藥物（或藥品）的通用名，不允許使用商品名，在一般情況下，醫師下達的醫囑是藥物，再由藥房藥劑師調劑，決定具體使用哪種藥品（藥物與藥品關係見後續章節），在個別情況下也可以由醫生指定使用的藥品。
所以在錄入用藥醫囑時，應當由醫生按照藥物進行錄入，由系統根據藥房預設指定的藥品進行處理，同時允許醫生變更藥物對應的藥品，系統自動根據藥品的規格，按照醫囑中單次劑量和每日用次，結合藥品的藥房包裝，計算出實際藥品在藥房包裝下的用量，再結合藥品單價計算費用。無論是藥物還是藥品，醫師下醫囑時都不關心藥品的批次。
2.3.4. 中草藥醫囑
中草藥醫囑涉及到中草藥處方，將其視作為一條西藥醫囑，在醫囑中一般用「***草藥湯劑」來替代，在醫囑不書寫草藥的明細內容，而是對應一張草藥處方。中草藥醫囑可以下在長期醫囑中，也可以下在臨時醫囑中。
中草藥處方按照「付」計算，在生成取藥單時，不能將所有組成草藥合計計算，應先按處方計算，然後乘以「付」數。
2.3.5. 診療醫囑
診療包括各種輔助檢查（化驗、超聲、病理、x線、ct/mr等）、特殊檢查**專案、藥物敏感試驗、會診、搶救等。一般下達在臨時醫囑中。
在下達化驗等檢查時，應允許同時填寫相關的檢查申請單，並列印。
2.3.6. 特殊醫囑
有些特殊醫囑，包括轉科、出院、手術（前/後）、分娩、死亡等醫囑，一旦下達後，立即停止當前所有的醫囑。
2.3.7. 重整醫囑
重整醫囑下達後，將當前正在執行的長期醫囑，按照醫囑內容順序和下達時間的先後次序，重新排列，但不改變醫囑的起始時間、內容等，也不停止這些醫囑內容。重整醫囑相當於將正在執行的長期醫囑複製乙份到新的位置，而醫囑自動作廢。當醫囑需要列印時，重整醫囑才有意義，在列印時，還需要在重整醫囑上方劃一條紅色橫線。
重整醫囑是歷史手工書寫醫囑的產物，主要是解決長期醫囑多次調整導致現執行的醫囑不好查閱的問題，在電子化後，這個功能將逐步取消。
總的來講，醫囑與病歷一樣，一旦下達並確認後，不允許刪除和修改，只能停止或作廢，醫囑電子化後也必須遵循這個要求。
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