在tcga中，乙個患者可能會對應多個樣本，如tcga-a6-6650可以得到3個樣本資料：
tcga-a6-6650-01a-11r-1774-07
tcga-a6-6650-01a-11r-a278-07
tcga-a6-6650-01b-02r-a277-07
大家知道一般在做tcga資料分析的時候樣本名實際上只保留到前四個元素（以」-「分割），例如tcga-a6-6650-01。所以實際上上示3個樣本一般只保留乙個，那該怎麼取捨呢？
在取捨之前，當然要先搞清楚樣本命名方式：
我們將此示圖以」-「分割，具體拆開解讀一下：
tcga：project, 所有tcga樣本名均以這個開頭，標誌
a6：tissue source site，組織**編碼，如a6就表示**於christiana healthcare中心的結腸癌組織。更多編碼所代表的意義詳見：
6650：participant, 參與者編號
01：sample, 這兩個數字可以說是最關鍵、最被大家注意的，其中編號01~09表示腫瘤，10~19表示正常對照，如下：
所以在tcga樣本名中，這個位置最常見的就是01和11，當然偶爾也會有其他的數字
a：vial, 在一系列患者組織中的順序，絕大多數樣本該位置編碼都是a; 很少數的是b，表示****固定石蠟包埋組織，已被證明用於測序分析的效果不佳，所以不建議使用-01b的樣本資料：
所以命名至此，已經可以開始用於區別不同的樣本了，以下將是更細節的描述：
所以現在看這三個樣本：
tcga-a6-6650-01a-11r-1774-07
tcga-a6-6650-01a-11r-a278-07
tcga-a6-6650-01b-02r-a277-07
其區別就在於，前兩個使用的是患者的冰凍組織做的測序，而第三個用的是****固定石蠟包埋組織；而前兩個樣本的區別在於同一組織後續使用了不同的96孔板。
理解了命名規則及三者命名上的主要區別後，現在可以重點解決如何從乙個患者的多個樣本中挑選樣本的問題了，首先排除tcga-a6-6650-01b-02r-a277-07，因為是-01b，****固定石蠟包埋組織！剩下的兩個：
tcga-a6-6650-01a-11r-1774-07
tcga-a6-6650-01a-11r-a278-07
先看看gdac firehose遇到這種情況怎麼解決，總結起來就是：
1、對rna資料來說，analyte為r的優先順序最該，其次是r和t，而對於dna層面的分析來說，d的優先順序最高。
2、如果analyte相同，那就選擇portion和/或plate值更大的。
所以按照gdac firehose的方法，最終保留tcga-a6-6650-01a-11r-a278-07，因為其相對於tcga-a6-6650-01a-11r-1774-07的板號(plate)更晚：
雖然看起來可能這麼選比較準確，但是稍微有些麻煩~
然後是cbioportal中的處理方式：
tcga樣本編號 TCGA資料分析 8
在獲得顯著性差異表達基因後，這裡我們再根據padj值，由差異分析結果中篩選10例顯著差異表達的基因以及這些基因在樣本中的表達矩陣。然後對這10例基因進行roc曲線分析和kaplan meier分析。1.篩選10例顯著差異表達基因 差異表達的3584基因表達譜 x d selected x d mat...
版本命名規範
1.版本命名規範 軟體版本號有四部分組成，第一部分為主版本號，第二部分為次版本號，第三部分為修訂版 本號，第四部分為日期版本號加希臘字母版本號，希臘字母版本號共有五種，分別為base alpha beta rc release 2.軟體版本階段說明 base 此版本表示該軟體僅僅是乙個假頁面鏈結，通...
版本命名規則
1.軟體版本階段說明 alpha版 此版本表示該軟體在此階段主要是以實現軟體功能為主，通常只在軟體開發者內部交流，一般而言，該版本軟體的bug較多，需要繼續修改。beta版 該版本相對於 版已有了很大的改進，消除了嚴重的錯誤，但還是存在著一些缺陷，需要經過多次測試來進一步消除，此版本主要的修改對像是...