KO 資料庫分類系統介紹

2021-09-07 10:03:22 字數 896 閱讀 8115

kegg orthology資料庫不僅對基因的功能進行了擴充和整理,還對功能進行了細緻的分類;

針對基因的功能,共有3級分類,第一級有6個大類;

開啟下面這個鏈結 可以看到 如下所示的一級分類

在左上角的4個灰色的朝下的三角形指示了不同的分類層級,第乙個代表一級分類,第二個代表二級分類,第******分類,第四個代表全部展開;

一級分類包含 代謝相關,遺傳資訊處理,環境因素處理,細胞過程,生物系統,人類疾病共6個大類;每個大類又對應不同的二級分類和**分類;

以代謝為例, 對應的二級分類有

在 代謝 這個大類下面,又分為碳水化合物代謝, 脂質代謝,氨基酸代謝,核酸代謝等共13個二級分類,在二級分類下面,又有對應的**分類

以overview 為例,包含碳代謝, 脂肪酸代謝等**分類;

對於某乙個基因來說,其產物的功能一般會有多個方面的作用,比如在代謝中發揮作用,在細胞組分中也會發揮作用,所以乙個k number 會出現在多個分類中,利用kegg 的api 可以直接返回某個k number 對應的具體資訊,格式如下

以k00844 為例, 會返回這個ko對應的資訊

可以看到,k00844 在代謝,環境因素處理,生物系統,人類疾病等方面都發揮了作用

資料庫管理系統的分類

資料庫管理系統 database management system 是一種操縱和管理資料庫的大型軟體,是用於建立 使用和維護資料庫,簡稱dbms。它對資料庫進行統一的管理和控制,以保證資料庫的安全性和完整性。使用者通過dbms訪問資料庫中的資料,資料庫管理員也通過dbms進行資料庫的維護工作。它提...

簡單介紹資料庫系統

資料庫系統 資料庫庫系統有3個主要的組成部分。資料庫應用程式 為了提高資料庫系統的處理能力所使用的管理資料庫的軟體補充。資料庫管理系統 用於管理資料庫的軟體。資料庫 用於儲存資料的地方。資料庫 database system 提供了乙個儲存空間用以儲存各種資料,可以將資料庫視為乙個儲存資料的容器。乙...

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