在ubuntu19 10下安裝AFNI

在用dtitk的過程中，涉及到用matlab呼叫load_untouch_nii函式，而這個函式屬於afni的，所以今天搞定了afni的安裝，記錄一筆。

宣告：以下步驟均來自afni官網，建議大家直接去afni官網看安裝步驟，偷懶的話可以看我這。

一：安裝依賴包

建議去官網複製貼上，官網很全面，我這裡貼一下**，從afni的官網複製過來

sudo add-apt-repository universe

sudo
apt-get update
sudo
apt-get
install -y tcsh xfonts-base python-qt4       \
gsl-bin netpbm gnome-tweak-tool   \
libjpeg62 xvfb xterm vim curl     \
gedit evince eog                  \
libglu1-mesa-dev libglw1-mesa     \
libxm4 build-essential            \
libcurl4-openssl-dev libxml2-dev  \
libssl-dev libgfortran3           \
gnome-terminal nautilus           \
gnome-icon-theme-symbolic         \
firefox
sudo
ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgsl.so.23 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgsl.so.19

二：解壓安裝

curl -o 

tcsh @update.afni.binaries -local_package ~/downloads/linux_ubuntu_16_64.tgz -do_extras

cp

$home/abin/afni.afnirc $home/.afnirc
#在這裡重新開啟terminal，或者source一下bashrc，讓環境生效
suma -update_env

export r_libs=

$home/r
mkdir
$r_libs
echo
'setenv r_libs ~/r'
>> ~/.cshrc
echo
'export r_libs=$home/r'
>> ~/.bashrc

rpkgsinstall -pkgs all

afni_system_check.py -check_all

afni
suma

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