軟體測試於ubuntu 16.04lts
ubuntu環境下預設~/bin為個人環境變數目錄
比較linux系統自帶gzip工具、多線gz壓縮工具pigz、以及最新適合fastq壓縮又快又小的軟體gtx(自稱只有傳統gzip的1/6體積，實測單執行緒速度快了3倍，體積減少為gzip的2/3大小)
gzip系統預設，無須安裝
pigz多執行緒壓縮工具，可通過ubuntu系統自帶的新立德工具箱一鍵安裝
sudo apt-get install pigzwget
# 解壓
tar zxvf gtz_public_0.2
.2k_ubuntu_release.tgz
# 進入程式目錄
cd gtz_public_0.2
.2k_ubuntu_release/
# 顯示幫助
./gtz -h
# 新增環境變數，一定要軟鏈，否則程式無法執行
ln -s `pwd`/gtz ~/bin/
使用bgiseq500產生的pe100測序檔案的一端作為測試。7.8gb，比較典型的測序樣品大小。
不支援多執行緒的gzip
time gzip -c test.fq > test.fq
.gz
# 注意-p一定要寫下前面，後面無效
time pigz -k -p 32 test.fq
time pigz -k -p 8 test.fq
time pigz -k -p 1 test.fq
time pigz -k test.fq
time gtz test.fq
# 時間31s，壓縮率24.3%(1.91/7.83g)，預設輸出檔案為otu.gtz，不刪除輸入檔案，cpu使用峰值為30執行緒
# 指定單執行緒數壓縮至指定檔案
time gtz test.fq -p 1 -o test.fq
.gtz
# 8m，壓縮率不變
time gtz test.fq -p 8 -o test.fq
.gtz
# 1m21s，壓縮率不變
time gtz test.fq -p 32 -o test.fq
.gtz
# 32s，壓縮率不變
執行緒gzip
pigz
gtz1
16m53s
23m46s8m8
-3m12s
1m21s32-
47s32s96-
50s31s
rate
36.5%
36.5%
24.3%
-代表不支援多執行緒。執行緒不要給太多，超過30幾乎沒有意義，反而速度下降，還浪費大量計算資源。
gunzip
time gunzip test.fq
.gz
time unpigz test.fq
.gztime unpigz -p 32 test.fq
.gztime unpigz -p 8 test.fq
.gztime unpigz -p 1 test.fq
.gz
gtz -d test.fq
.gtz
gtz -d test.fq
.gtz -p 32
gtz -d test.fq
.gtz -p 8
gtz -d test.fq
.gtz -p 1
執行緒gunzip
unpigz
gtz1
1m32s
55s12m22s8-
54s1m51s32-
55s53s96-
50s39s
以標準的gzip為對照，點評另兩另個並行軟體pigz和gtz的優缺點；
在壓縮上，單執行緒，pigz反而更慢50%，而gtz速度可以提高一倍；在多執行緒時，速度在前30執行緒內可線性提高，優勢明顯。gtz在速度和壓縮率上更勝一籌，30執行緒時時間和壓縮比仍比pigz超50%，但絕對沒有宣傳的壓縮率提高7倍這麼牛。
在解壓上，unpigz也不支援多執行緒，但比gunzip略快。gtz由於壓縮率略高，解壓演算法較複雜，在32執行緒時才比單執行緒解壓的unpigz更快，這對計算需求大壓力也比較大。
此外，gtz格式目前還是非主流，並不能被其它軟體直接使用，因此只適合儲存備份長期不用的檔案，還是值得使用的。但常用軟體目前不能直接使用此格式。
快速壓縮解壓還是要使用gz格式，主流軟體支援好，解壓速度快，占用資源少。
gzip中文幫助
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