機械硬碟的保護，其實很簡單。但要想真正的保護硬碟，首先得先從硬碟的原理說起。硬碟的原理其實就是內部的磁頭在一片或數片圓形的磁碟上通過電磁流將資訊讀取或寫入。磁碟在硬碟通電後快速旋轉，磁頭在磁碟上滑動傳入主機板以達到訪問資料。其中硬碟最為精貴就是磁頭與磁碟。
造成硬碟損壞的原因有以下幾種：
硬碟在工作時，磁碟一般都處於高速旋轉狀態。如果這時突然斷電，磁頭有可能會劃傷碟片，損壞其中資料的完整性。目前一些硬碟裡安裝了一塊極小的「電池」，在外部電源斷電的瞬間，機械硬碟會利用這塊電池的電量優先將磁頭挪動到安全區域，避免劃傷碟片。雖然有這樣的保護，但在使用過程中，還是應當避免突然斷電。
在專業領域，如：監控、伺服器等，這些資料要比個人硬碟中的資料更為寶貴。在這些存放資料的硬碟或硬碟組旁，一般都配有 ups（即不間斷電源），在遇到不可抗力的突然斷電時，ups 中配備的蓄電池會代替主電源繼續工作，直到電力恢復或蓄電池沒電。
如今的硬碟大部分都是密封機身，一般只有乙個過濾的氣孔，用來平衡工作時產生的熱量導致的氣壓差。但在灰塵嚴重的環境下，氣孔很容易吸入空氣中的灰塵，灰塵長期積累在硬碟的內部，會影響電子元器件的散熱，使得電路板等元器件的溫度上公升，產生漏電而燒壞元件，造成一些莫名其妙的問題。所以灰塵體積雖小，但對硬碟的危害是不可低估的。
因此必須保持環境衛生，減少空氣中的濕度和含塵量。這裡要注意的是：一般使用者不能自行拆開硬碟蓋，否則空氣中的灰塵進入硬碟內，嘗試物理修復請到專業機構，避免在磁頭進行讀、寫操作時劃傷碟片或磁頭。
硬碟是一種精密的裝置，在工作中磁頭與磁碟的互動距離會達到幾微公尺。在受到外力衝擊時，磁頭會在磁碟上留下損傷。在高溫度、高磁場、靜電的情況，對硬碟也是損傷很大，從部分資料損壞到整個硬碟報廢，都有可能。所以在攜帶、移動、使用的過程中，一定要多加小心。
可以說，機械硬碟的抗震抗摔能力比較差，不單單行動硬碟，對於機械硬碟都是這樣。這個可以從硬碟結構上看。硬碟的抗震效能差就**於碟片和磁頭的接觸。它們之間如果有因為震動等造成較強烈的作用的話，就有可能出現物理壞道。
hass（硬碟主動穩定系統）是萬拓儲存基於旋轉式磁性硬碟（hard disk drive, hdd）的應用研究，不斷提高硬碟可靠性的磁碟處理技術，使硬碟故障率減少80%以上。通過資料排隊、分類、快取等技術，大大減少硬碟的機械磨損，延長硬碟的使用壽命。
另外，為了降低硬碟間共振對硬碟造成的損壞，萬拓儲存研發了獲得專利的一體成型導軌，有效改善硬碟間共震，穩定、低噪音。還有獲得專利的一體防震托盤架，保證最大進風量，散熱更有效，減小磁碟震動。全方位保護硬碟，延長硬碟使用壽命。
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