安裝freebayes所遇到的問題

2021-08-14 08:45:32 字數 1409 閱讀 8754

git clone --recursive git:
安裝好後會出現乙個freebayes資料夾，然後進入它：

cd freebayes
之後開始編譯，使用make：

make
此時，就可能會出現問題，無法編譯（因為我的centos安裝了g++、gcc、c++，所以這裡沒有辦法演示錯誤資訊）。這個原因就是用g++、gcc、c++編譯的軟體，必須得要安裝g++、gcc、c++，所以這裡要使用yum來安裝，如果是ubuntu則用apt-get安裝。

sudo yum install gcc-c++
然後，接著重新make編譯，此時，也許會出現第二個問題：

其實，這也是乙個很常見的問題，那是因為freebayes有python介面，從資料夾裡面的python資料夾就可以看出來。

所以，此時還需要安裝乙個包：

看提示的結果，如果是patchlevel.h：沒有那個檔案或目錄，則：

（這裡還有乙個地方需要注意：centos和ubuntu安裝的包名不一樣）

ubuntu安裝法：

sudo apt-get install python-dev
centos安裝法：

yum install python-devel
看提示的結果，如果是bzlib.h：沒有那個檔案或目錄， 則：

ubuntu安裝法：

sudo apt-get install libbz2-dev
centos安裝法：

yum install zlib-devel bzip2-devel sqlite sqlite-devel openssl-devel
把這些安裝完後，再使用make編譯，應該是沒有問題。（我是沒有再遇上問題了。）

最後安裝好了的freebayes：

至此freebayes安裝完畢，希望給遇上相同問題的小夥伴可以提供一點幫助！

注： freebayes幫助文件：

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