至此安裝就大功告成了,接下來,就是介面優化了,傳統的介面,是將所有物種全部列出,如果物種少,對介面沒有太大的影響,但是,如果物種一多起來,那麼,這個介面將被無限拉長,既不美觀,也不方便他人的使用。因此,本人在此使用jstree這也小外掛程式來解決這一問題。
5 jstree 的新增
1)新增前需要的外掛程式:
1、jstree的css檔案,具體的,是在目錄/public/css中加入themes資料夾,新增相關檔案即可
2、jstree的js檔案,只有檔案jstree.js、jstree.min.js兩個,在public/js中加入這兩個檔案即可。
2)新增前需要的操作;
1、對原始檔案重新命名分別命名為a_b_genome.fasta、a_b_proteins.fasta、a_b_cds.fasta、a_b_scaffold.fasta
2、對原始檔案中的序列號進行重新命名,該步驟因人而異,但序列號中必須有物種名(links.rb中對此有嚴格要求)
6 配置系統檔案,使系統支援jstree這一外掛程式
1)在檔案gruntfile.js中指定jstree.min.js的所在位置('/public/js/d3.v3.min.js')
2)修改檔案links.rb,修改的目的是為了保證sequenceserver能在後台識別blast庫中的不同物種,並給這些檔案取乙個新名字,方便接下來的分類修改格式為
taxa["seq_id"] = "seq_id"
(說明:中括號中的資訊是原始檔中的序列資訊,等號右邊的是新取的名字)
3) 在資料夾/lib/sequenceserver中加入 hierarchy.rb這一檔案,該檔案的作用是將不同物種按生物學依據分類
'species1' => 'group1'
4) 在目錄檔案sequenceserver.rb(path:/lib)中新增子目錄hierarchy.rb
5)對routes.rb也有相應的操作,略。
7 修改sequenceserver介面
直接對目錄/views下的search.erb進行操作可按照需要修改導航欄,但是目前尚未解決導航欄下拉列表顯示問題。
(本說明文件僅由本人修改、總結、其中有新添一些步驟,如有疑問,可聯絡:qq1165186532)
mongodb els memcached安全漏洞
elasticsearch漏洞 漏洞 cve 2014 3120 命令執行 cve 2015 3337 目錄穿越 cve 2014 3120 命令執行 啟動 docker compose build docker compose up d cve 2015 3337 目錄穿越 在安裝了具有 site...
pureftp mysql pureftp安裝部署
ftp 檔案傳輸 pure ftpd ftp軟體 作用 通過對映登入傳送和接收檔案。wget 2 解壓包 tar jxvf pure ftpd 1.0.43.tar.bz2 3 進入解壓目錄 cd pure ftpd.4 初始化安裝環境 先建立安裝目錄mkdir usr local pureftpd...
thinkphp nginx phpcgj安裝配置
環境 mysql 5.6.26 nginx 1.9.4.tar.gz php 5.6.13 程式框架thinkphp 客戶要求必須使用nginx php 1.首先安裝nginx mysql php 2.安裝擴充套件php擴充套件 pdo mysql 1 cd usr local src php 5....