蛋白PDB檔案格式

2021-07-24 10:42:56 字數 1287 閱讀 1941

列 

資料型別

欄位名稱 

定義描述

1 - 6 

record name

"dbref "

8 - 11

idcode 

idcode 

記錄的id號

13 character

chainid 

鏈的識別符號

15 - 18 

integer 

seqbegin 

pdb序列片段的起始序列號

19 achar 

insertbegin

pdb序列片段的起始插入**

21 - 24 

integer 

seqend

pdb序列片段的終止序列號

25 achar 

insertend 

pdb序列片段的終止插入**

27 - 32 

lstring

database

序列資料庫名稱如

pdb,

sws,當乙個相應的序列資料庫記錄還未識別時即存放

pdb

34 - 41 

lstring

dbaccession 

序列資料庫的訪問號碼,如對於

genbank

來說即是

ncbi gi

43 - 54 

lstring

dbidcode 

序列資料庫的識別密碼,對

gb來說即是訪問號碼

56 - 60 

integer 

dbseqbegin 

資料庫片段的起始序列號

61 achar 

idbnsbeg 

涉及到pdb

的話,存放片段起始殘基的插入**

63 - 67

integer 

dbseqend 

資料庫片段的終止序列號

68 achar 

dbinsend 

涉及到pdb

的話,存放片段終止殘基的插入**。

原文出自:蛋白質pdb檔案說明.doc

英文版:pdb primary structure section

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