安裝環境：gcc –v 4.8.2
openmpi –v 1.4.3
abyss依賴的庫有：boost, openmpi, sparsehash, sqlite
安裝abyss之前要先安裝boost, sparsehash, sqlite，下面安裝示例均安裝在$home目錄下，建議安裝到自己建立的目錄下，將安裝包解壓到自己建立的目錄中，再按照示例步驟操作，boost的配置不變，其他配置時--prefil=$home改為--prefix=/change_path_to_your_dir, 安裝abyss時，依賴sqlite的路徑也要修改為安裝sqlite的路徑，將cppflags=-i$home/include裡面的$home相應改為安裝的路徑。
第一步，安裝boost
獲取包：
$wget
解壓：$tar –zxvf boost_1_56_0.tar.gz
進入解壓後的目錄：
$cd boost_1_56_0
配置：$ ./bootstrap.sh--prefix=path/to/installation/prefix
安裝：$ ./b2 install
第二步，安裝sparsehash
獲取包：
$wget
解壓：$ tar -zxvfsparsehash-sparsehash-2.0.3.tar.gz
進入解壓後的目錄：
$ cd sparsehash-sparsehash-2.0.3
配置：$./configure --prefix=$home
編譯：$make
安裝：$make install
第三步，安裝sqlite
獲取包：
$ wget
解壓：$ tar -zxvf sqlite-autoconf-3130000.tar.gz
進入解壓後的目錄：
$ cd sqlite-autoconf-3130000/
配置：$./configure --prefix=$home
編譯：$make
安裝：$make install
第四步，安裝abyss
獲取包：
$ wget
解壓：$ tar -zxvf abyss-1.9.0.tar.gz
進入解壓後的目錄：
$ cd abyss-1.9.0/
配置：要連線上已經安裝在集群系統上的openmpi的庫，sqlite
$./configure --enable-maxk=96--with-mpi=/public/soft/ompi143-gnu/lib/openmpi --with-sqlite=$home--prefix=$home cppflags=-i$home/include
編譯：$make
安裝：$make install
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