突然發現用eclipse管理git時，eclipse本身會成為下一級repository。
也就是說，eclipse裡面commit時會commit到eclipse裡自己快取的乙個repository，這個貌似在d:\program files\git\下面，只有在push時，才會推送到上層git的.git庫里，此時只有庫里的資訊變了，它下面用來初始化的檔案並沒有更新。
換句話說，初始化的目錄a裡只有.git下面的東西才是重要的，後面clone之後操作的都是clone後的庫和目錄b，commit操作只對clone後的庫b的.git有作用，push可以把修改推送到clone的源a的.git，但是也不會影響到初始化的目錄a中的內容，如果修改初始化目錄a下面的檔案，再操作庫a，使用commit，則可以改變a中的.git庫，否則a下面的檔案始終為初始化時的版本。
所以初始化之後，純作為repository時，可以考慮刪除或移走a下的.git之外的檔案。
現在想想，可能是由於最開始匯入專案時，使用了clone，如果直接開啟應該不是這樣吧。
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